JEP - Sentencia TP SeRVR RC ST 002 18 septiembre 2025

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R A D I C A D O L E G A L I : 0 0 0 1 8 1 38 5 . 2 0 2 2 . 0 . 0 0 . 0 0 0 1 .

JURISDICCIÓN ESPECIAL PARA LA PAZ

TRIBUNAL PARA LA PAZ

SECCIÓN DE PRIMERA INSTANCIA PARA CASOS DE

RECONOCIMIENTO DE VERDAD Y RESPONSABILIDAD

SENTENCIA TP-SeRVR-RC-ST-No.002 de 2025

Bogotá D.C., dieciocho (18) de septiembre de dos mil veinticinco (2025)

Expediente

LEGALi:

Caso:

0001813-85.2022.0.00.0001 Caso No. 03 , Subcaso Costa Caribe, “asesinatos y desapariciones forzadas ilegítimamente presentados como bajas en combate por agentes del Estado”, Batallón de Artillería No. 2 “La Popa”.

ASUNTO

La Sección de Primera Instancia para casos de Reconocimiento de Verdad y Responsabilidad (Sección de Reconocimiento o SeRVR) de la Jurisdicción Especial para la Paz (JEP), en ejercicio de sus facultades constitucionales, legales y reglamentarias, administrando justicia en nombre de la República de Colombia y por autoridad de la ley, procede a dictar sentencia en el marco del caso No. 03, asesinatos y desapariciones forzadas ilegítimamente presentados

y reglamentarias, administrando justicia en nombre de la República de Colombia y por autoridad de la ley, procede a dictar sentencia en el marco del caso No. 03, asesinatos y desapariciones forzadas ilegítimamente presentados como bajas en combate por agentes del Estado – subcaso Co sta Caribe por hechos ocurridos entre enero de 2002 y julio de 2005 , atribuibles a algunos integrantes del Batallón de Artillería No. 2 La Popa.

TABLA DE CONTENIDO

I. ANTECEDENTES ......................................................................................................................................................... 12

II. CONSIDERACIONES ................................................................................................................................................. 15

COMPETENCIA ............................................................................................................................................................... 15 ASPECTOS PRELIMINARES ........................................................................................................................................ 15 a. La JEP como componente de justicia del Sistema Integral de Verdad, Justicia, Reparación y No Repetición (SIVJRNR) ...................................................................................................................................................................... 15 b. Individualización de los comparecientes .............................................................................................................. 18 c. Estructura de argumentación .................................................................................................................................. 18Página 2 de 584

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R A D I C A D O L E G A L I : 0 0 0 1 8 1 38 5 . 2 0 2 2 . 0 . 0 0 . 0 0 0 1 .

PRIMER ACÁPITE: EL FENÓMENO CRIMINAL DE ASESINATOS Y DESAPARICIONES PRESENTADOS ILEGÍTIMAMENTE COMO MUERTES EN COMBATE.......................................................... 21

1.1. La priorización del Subcaso Costa Caribe, batallón de Artillería No. 2 “La Popa”, del Caso 03 ................ 26 1.2. El universo de hechos victimizantes sobre los cuales fue realizado el proceso de contrastación y los Patrones de criminalidad ocurridos en el subcaso Costa Caribe ........................................................................... 31 1.2.1. Primer patrón de hechos criminales ocurridos en el marco de una alianza y relación de connivencia entre miembros del batallón La Popa y grupos paramilitares .......................................................................... 34 1.2.2. Segundo patrón de hechos criminales ocurridos en contra de personas en situación vulnerabilidad que fueron aprehendidas irregularmente o engañadas con falsas promesas de trabajo o negocio ............. 37 1.3. Principales características de las víctimas del caso ........................................................................................... 41 1.3.1. Características de las víctimas individuales .............................................................................................. 44 1.3.2. Pueblos Indígenas y Afrodescendientes del Subcaso ............................................................................... 50 1.3.2.1. Pueblos Indígenas ................................................................................................................................ 50 1.3.2.1.1. Pueblo Indígena Kankuamo ...................................................................................................... 50 1.3.2.1.2. Pueblo Indígena Wiwa ............................................................................................................... 51 1.3.2.2. Pueblo Afrodescendiente .................................................................................................................... 53

1.3.2.1.1. Pueblo Indígena Kankuamo ...................................................................................................... 50 1.3.2.1.2. Pueblo Indígena Wiwa ............................................................................................................... 51 1.3.2.2. Pueblo Afrodescendiente .................................................................................................................... 53 1.3.2.2.1. Consejo Comunitario Kusuto MaGende ................................................................................. 53 1.3.2.2.2. Consejo Comunitario José Prudencio Padilla ......................................................................... 54 1.4. El impacto del conflicto armado interno ............................................................................................................ 56 1.4.1. Las circunstancias de contexto identificadas por la Sala de Reconocimiento ....................................... 56 1.4.2. Diversas instituciones judiciales y de control han destacado el despliegue de estructuras armadas en la región de la Costa Caribe ................................................................................................................................... 57 1.4.3. El contexto de la presencia de los actores armados ilegales en el área de operaciones asignadas al Batallón ............................................................................................................................................................... 58 1.4.4. Llegada, presencia y actividades de las antiguas FARC – EP en la región ............................................ 62 1.4.5. Llegada y presencia del Ejército de Liberación Nacional ......................................................................... 67 1.4.6. Incursión y consolidación de las Autodefensas Unidas de Colombia .................................................... 69 1.4.7. Presencia de la fuerza pública en el territorio ........................................................................................... 79 1.4.8. Relacionamiento del batallón La Popa con la población civil en el territorio ....................................... 89

SEGUNDO ACÁPITE: RESPONSABILIDAD PENAL INDIVIDUAL DE LOS MÁXIMOS RESPONSABLES ............................................................................................................................................................................................. 98 2.1. Calificación jurídica propia, definición y elementos de los crímenes internacionales cometidos ............ 103

SEGUNDO ACÁPITE: RESPONSABILIDAD PENAL INDIVIDUAL DE LOS MÁXIMOS RESPONSABLES ............................................................................................................................................................................................. 98 2.1. Calificación jurídica propia, definición y elementos de los crímenes internacionales cometidos ............ 103 2.1.1. Ley de Origen y Sistemas de Justicia propia............................................................................................ 106 2.1.1.1. Ley de Origen de los Pueblos Indígenas Kankuamo y Wiwa ...................................................... 107 2.1.1.1.1. Sistema de Justicia Propia del Pueblo Indígena Kankuamo ............................................... 111 2.1.1.1.2. Sistema de Justicia Propia del Pueblo Indígena Wiwa ........................................................ 115 2.1.1.2. Sistema de Justicia de los Consejos Comunitarios Kusuto MaGende y José Prudencio Padilla 118 2.1.2. Crímenes de lesa humanidad .................................................................................................................... 120 2.1.2.1. Asesinato como delito de lesa humanidad ..................................................................................... 125 2.1.2.2. Desaparición forzada de personas como delito de lesa humanidad ........................................... 127 2.1.2.3. Delito de tortura como delito de lesa humanidad ......................................................................... 132 2.1.2.4. Persecución como delito de lesa humanidad ................................................................................. 138 2.1.3. Crímenes de guerra ..................................................................................................................................... 141 2.1.3.1. Homicidio como crimen de guerra .................................................................................................. 142 2.1.3.2. Tortura como crimen de guerra ....................................................................................................... 144 2.2. Títulos de imputación de los delitos ................................................................................................................. 146 2.2.1. La autoría y la participación ...................................................................................................................... 147

2.1.3.2. Tortura como crimen de guerra ....................................................................................................... 144 2.2. Títulos de imputación de los delitos ................................................................................................................. 146 2.2.1. La autoría y la participación ...................................................................................................................... 147 2.2.1.1. Estructuras de imputación para establecer la responsabilidad ................................................... 151 2.3. Configuración de los elementos de contexto de los crímenes en el presente subcaso ....................... 161 2.3.1. El universo de hechos del Subcaso ................................................................................................. 162 2.3.2. La estructura militar responsable ................................................................................................... 165 2.3.3. Configuración de los elementos contextuales de los crímenes internacionales de lesa humanidad y los crímenes de guerra ................................................................................................................. 171 2.4. Máximos responsables determinados por la SRVR ................................................................................ 176 2.4.1. Responsabilidad penal individual del compareciente Heber Hernán Gómez Naranjo .......... 179 2.4.2. Responsabilidad penal individual del compareciente Guillermo Gutiérrez Riveros .............. 184 2.4.3. Responsabilidad penal individual del compareciente Efraín Andrade Perea .......................... 188 2.4.4. Responsabilidad penal individual del compareciente Manuel Valentín Padilla Espitia ......... 192 2.4.5. Responsabilidad penal individual del compareciente Carlos Andrés Lora Cabrales .............. 197 2.4.6. Responsabilidad penal individual del compareciente Eduart Gustavo Álvarez Mejía ........... 201Página 3 de 584

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2.4.7. Responsabilidad penal individual del compareciente José de Jesús Rueda Quintero ............. 204 2.4.8. Responsabilidad penal individual del compareciente Elkin Leonardo Burgos Suárez ........... 206 2.4.9. Responsabilidad penal individual del compareciente Elkin Rojas ............................................. 209 2.4.10. Responsabilidad penal individual del compareciente Yeris Andrés Gómez Coronel ............. 211 2.4.11. Responsabilidad penal individual del compareciente Alex José Mercado Sierra .................... 214 2.4.12. Responsabilidad penal individual del compareciente Juan Carlos Soto Sepúlveda ................ 216 2.5. Comisión de los crímenes de tortura y persecución ............................................................................... 219

TERCER ACÁPITE: LA JUSTICIA TRANSICIONAL RESTAURATIVA EN LA JEP ...................................... 228 3.1. Dimensión restaurativa del proceso judicial ante la JEP y especialmente ante esta Sección de Reconocimiento .......................................................................................................................................................... 228 3.1.1. Prácticas Restaurativas ............................................................................................................................... 233 3.2. Acciones en desarrollo de la Justicia Restaurativa en el Subcaso ................................................................. 236

Reconocimiento .......................................................................................................................................................... 228 3.1.1. Prácticas Restaurativas ............................................................................................................................... 233 3.2. Acciones en desarrollo de la Justicia Restaurativa en el Subcaso ................................................................. 236 3.2.1. Acciones encaminadas a la satisfacción de los derechos de las víctimas, en el marco del derecho a la reparación integral ................................................................................................................................................ 241 3.2.1.1. Prácticas restaurativas: encuentros dialógicos restaurativos entre las víctimas y los comparecientes o diálogos restaurativos interculturales .......................................................................... 241 3.2.1.2. Metodología de los encuentros dialógicos privados como prácticas restaurativas .................. 243 3.2.2 Rituales de mortuoria, limpieza y sanación .............................................................................................. 244 3.2.3. Medidas en favor de la contribución a la reparación integral de las víctimas .................................... 250 3.2.3.1. Impulso judicial y coordinación para la búsqueda de personas desaparecidas ........................ 252 3.2.3.2. Acciones relacionadas con el enfoque restaurativo en equilibrio con las necesidades del proceso judicial transicional ........................................................................................................................................ 253 3.2.3.2.1. Audiencia de observaciones a la Resolución de Conclusiones No. 03 de 2022 ................ 253 3.2.3.2.2. Diligencias para la ampliación de la caracerización del daño sufrido por las víctimas .. 256 3.3. Los estándares de reparación de crímenes internacionales ........................................................................... 259 3.3.1. Medidas de reparaciones ............................................................................................................................ 262 3.3.2. Reparación en el Derecho Internacional de los Derechos Humanos .................................................... 267 3.3.3. Reparación en el Derecho Penal Internacional ........................................................................................ 272

3.3.1. Medidas de reparaciones ............................................................................................................................ 262 3.3.2. Reparación en el Derecho Internacional de los Derechos Humanos .................................................... 267 3.3.3. Reparación en el Derecho Penal Internacional ........................................................................................ 272 3.4. Modelo de reparación colombiano ................................................................................................................... 275 3.4.1. La validez de la garantía del derecho a la reparación integral a través del uso de mecanismos judiciales y extrajudiciales ..................................................................................................................................................... 279 3.5. El derecho a la reparación integral de las víctimas del conflicto en el Acuerdo Final de Paz ................... 281 3.6. La obligación estatal de garantizar la reparación ............................................................................................ 282 3.6.1. La obligación estatal de garantizar las condiciones para que los comparecientes puedan contribuir a la reparación de las víctimas del conflicto ......................................................................................................... 285 3.7. Componentes del modelo de reparación del Acuerdo de Paz de 2016 ........................................................ 286 3.7.1. Medidas de reparación integral para la construcción de paz ................................................................ 287 3.7.2. Ley 1448 de 2011 .......................................................................................................................................... 294 3.7.2.1. Vigencia de la Ley 1448 de 2011 y Ley 2078 de 2021 ..................................................................... 298 3.7.3. Rol de los componentes del SIVJRNR, en su conjunto, en materia de reparación.............................. 299 3.8. Rol de la JEP en la realización del derecho a la reparación integral de las víctimas del conflicto ............ 301 3.8.1. Límites de la JEP en la garantía del derecho a la reparación integral de las víctimas del conflicto . 303 3.9. Medidas de reparación en el marco del proceso judicial del Subcaso a partir de la caracterización del daño ............................................................................................................................................................................. 307

3.9. Medidas de reparación en el marco del proceso judicial del Subcaso a partir de la caracterización del daño ............................................................................................................................................................................. 307 3.9.1. Aspectos conceptuales del daño ................................................................................................................ 310 3.9.2. Daño y violaciones a los derechos humanos e infracciones al derecho internacional humanitario . 311 3.9.3. Daño y reparación ....................................................................................................................................... 313 3.10. La identificación y caracterización del daño al interior de la JEP ............................................................... 314 3.10.1. La importancia de identificar y caracterizar el daño en la JEP más allá de las sanciones ................ 318 3.10.2. Uso de enfoques diferenciales para caracterizar el daño ..................................................................... 319 3.11. Caracterización del daño en el subcaso Costa Caribe................................................................................... 321 3.11.1. Fuentes para la caracterización del daño en el subcaso Costa Caribe ................................................ 322 3.11.2. Caracterización de las víctimas ............................................................................................................... 323 3.11.2.1. Caracterización del daño en el caso de los Pueblos Indígenas .................................................. 325 3.11.3. Afectaciones ocasionadas a las víctimas ................................................................................................. 325 3.11.3.1. Afectaciones causadas por la estigmatización ............................................................................. 326 3.11.3.2. Afectaciones causadas por la impunidad de los crímenes ......................................................... 331 3.11.3.3. Afectaciones causadas por el rompimiento de estructuras familiares ...................................... 333 3.11.3.4. Afectaciones comunitarias y socioculturales causadas por el rompimiento del tejido social 335Página 4 de 584

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3.11.3.4. Afectaciones comunitarias y socioculturales causadas por el rompimiento del tejido social 335Página 4 de 584

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3.11.3.5. Afectaciones comunitarias y socioculturales causadas al Pueblos Wiwa y Pueblo Kankuamo 336 3.11.3.6. Afectaciones comunitarias y socioculturales causadas al Consejo Comunitario José Prudencio Padilla 339 3.11.3.7. Afectaciones comunitarias y socioculturales causadas al Consejo Comunitario Kusuto MaGende ........................................................................................................................................................ 341 3.11.3.8. Afectaciones causadas por el desconocimiento sobre el paradero y la suerte de una persona desaparecida ................................................................................................................................................... 342 3.11.3.9. Afectaciones materiales y patrimoniales ..................................................................................... 345 3.11.3.10. Afectaciones al proyecto de vida ................................................................................................ 347 3.11.3.11. Afectaciones al proyecto de vida de las mujeres buscadoras .................................................. 348

3.11.3.10. Afectaciones al proyecto de vida ................................................................................................ 347 3.11.3.11. Afectaciones al proyecto de vida de las mujeres buscadoras .................................................. 348 3.11.3.12. Afectaciones al proyecto de vida de las hijas e hijos de las personas asesinadas y desaparecidas 350 3.11.3.13. Afectaciones a la salud mental .................................................................................................... 352 3.11.3.14. Afectaciones a la salud física ....................................................................................................... 354 3.11.3.15. Afectaciones transgeneracionales ............................................................................................... 354 3.11.4. Derechos vulnerados por los patrones de criminalidad identificados en el Subcaso ...................... 355 3.11.5. Territorios afectados ................................................................................................................................. 359 3.11.6. Continuidad de factores de vulnerabilidad, violencia y pobreza ....................................................... 366 3.11.7. Pérdida de confianza institucional por parte de las víctimas como resultado de los crímenes ...... 369 3.12. Disposición de los comparecientes para restaurar y reparar el daño causado .......................................... 371 3.13. Hallazgos en la investigación y juzgamiento de estos delitos ..................................................................... 373 3.13.1. Denuncias elevadas por las víctimas y organismos internacionales .................................................. 380

CUARTO ACÁPITE: SANCIONES PROPIAS ......................................................................................................... 384 4.1. Sistema de tratamientos, beneficios y sanciones ante la JEP ......................................................................... 385 4.2. Aspectos centrales de las sanciones propias .................................................................................................... 389 4.2.1. Las funciones y finalidades de las sanciones en el sistema de justicia transicional colombiano derivado del AFP y particularmente los objetivos de la sanción propia ........................................................................ 392

4.2. Aspectos centrales de las sanciones propias .................................................................................................... 389 4.2.1. Las funciones y finalidades de las sanciones en el sistema de justicia transicional colombiano derivado del AFP y particularmente los objetivos de la sanción propia ........................................................................ 392 4.2.2. Las sanciones propias deben satisfacer el principio de razonabilidad, ponderación y proporcionalidad tanto en su diseño como en su imposición ........................................................................................................ 395 4.2.3. Componentes de las sanciones propias: los Trabajos, Obras o Actividades Reparadoras y Restauradoras (TOAR) ......................................................................................................................................... 398 4.2.3.1. Funciones restauradores y reparadoras de los trabajos, obras o actividades ............................ 399 4.2.3.2. Participación efectiva de las víctimas y de no lesión de sus derechos ........................................ 400 4.2.3.3. Deber de contribuir a la reparación y a la restauración del daño causado ................................ 404 4.2.3.4. De ben ser aptos para alcanzar la reintegración del compareciente a la sociedad y la reconstrucción de los lazos sociales ............................................................................................................ 405 4.2.3.5. Compromisos del Estado para el adecuado cumplimiento de las sanciones propias ............. 406 4.2.4. Propuestas de proyectos de TOAR y responsables de su diseño y ejecución ..................................... 407 4.2.4.1. Trabajos, Obras o Actividades (TOAR) y proyectos TOAR ........................................................ 407 4.2.4.2. Origen de los TOAR y los proyectos TOAR .................................................................................. 409 4.2.4.3. Financiación de los TOAR y proyectos TOAR .............................................................................. 412 4.2.4.4. Carácter restaurativo y reparador cuando el TOAR o proyecto hace parte de la oferta

4.2.4.3. Financiación de los TOAR y proyectos TOAR .............................................................................. 412 4.2.4.4. Carácter restaurativo y reparador cuando el TOAR o proyecto hace parte de la oferta institucional .................................................................................................................................................... 414 4.2.4.5. Rutas para impulsar la estructuración de proyectos de TOAR y acciones TOAR ................... 416 4.2.4.6. Artículación con el Gobierno nacional para la financiación e implementación de los TOAR 421 4.2.5. Componentes de las sanciones propias: restricción de libertades y derechos .................................... 424 4.2.6. Restricciones efectivas de la libertad ........................................................................................................ 431 4.3. El componente reparador y restaurador de las sanciones propias en el subcaso Costa Caribe ................ 440 4.3.1. El proceso participativo implementado por la Sección .......................................................................... 443 4.3.2. Acciones judiciales específicas realizadas en el marco de este Subcaso, con el propósito de verificar las condiciones para la imposición de las sanciones propias y ruta para estructuración de los proyectos 450 4.3.3. Relación de proyectos que serán incluidos en la sentencia, para el cumplimiento de la sanción propia 457 4.3.3.1. Centro de armonización para el buen vivir de las familias del Pueblo Kankuamo ................. 457 4.3.3.2. Plan Integral de memorialización para la Costa Caribe .............................................................. 461 4.3.3.3. Centro Integral Cultural y de Memoria OMONAPA .................................................................. 465 4.3.3.4. Fortalecimiento productivo multipropósito (urbano y rural) Sembradores de amor y paz ... 469

4.3.3.3. Centro Integral Cultural y de Memoria OMONAPA .................................................................. 465 4.3.3.4. Fortalecimiento productivo multipropósito (urbano y rural) Sembradores de amor y paz ...